Jednorazowo przy następnym restarcie:

% touch /forcefsck
% shutdown -rF now

Aby wymusić pełne sprawdzanie przy każdym starcie, zmień cmdline.txt albo konfigurację GRUB.

cmdline.txt:

% sed -i 's/.*/& fsck.mode=force/' /boot/cmdline.txt

GRUB:

% sed -i 's/\(GRUB_CMDLINE_LINUX_DEFAULT=".*\)"/\1 fsck.mode=force"/' /etc/default/grub
% grep GRUB_CMDLINE_LINUX_DEFAULT /etc/default/grub
GRUB_CMDLINE_LINUX_DEFAULT="loglevel=4 mitigations=off fsck.mode=force"

Refs